Catan Junior transcurre en un anillo de seis islas en el que los jugadores construyen escondrijos y encuentran la misteriosa isla encantada, en la que vive La Pirata Rapaz. Cada isla genera un recurso especí­fico: madera, piñas, ovejas, sables y oro. Los jugadores deben usar estos recursos para construir barcos, extender sus dominios y construir nuevas guaridas desde los que dominar el tablero.